Program Studi Pendidikan Bahasa Indonesia dipimpin Ketua Program Studi yang mempunyai kewenangan mengelola pelaksanaan kebijakan akademik dan kemahasiswaan di tingkat program studi. Pengelolaan kebijakan keuangan dan pengembangan infrastruktur, seperti yang terdapat pada fakultas lainnya dikendalikan secara terpusat oleh Universitas yang secara langsung bertanggung jawab kepada Yayasan Bina Darma melalui Rektor Universitas Bina Darma. Pengelolaan program studi yang transparan dan akuntabel menjadi prioritas utama di lingkungan Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan (FKIP) Universitas Bina Darma.

Tata cara pemilihan pimpinan Program Studi Pendidikan Bahasa Indonesia mengikuti peraturan yang ditetapkan oleh Rektor Universitas Bina Darma tentang tata cara pengangkatan Ketua Program Studi maupun bagian lain di lingkungan Universitas Bina Darma. Program Studi Pendidikan Bahasa Indonesia juga mengikuti peraturan-peraturan lain yang dibuat di tingkat universitas dan fakultas, antara lain tentang etika tenaga akademik, etika mahasiswa, etika tenaga kependidikan, sistem penghargaan dan sanksi serta prosedur pelayanan. Hal ini mencerminkan bahwa Program Studi Pendidikan Bahasa Indonesia telah melakukan pengelolaan program studi yang bertanggung jawab dan adil.